Atualmente, estão localizados nos municípios de Itacoatiara, Lábrea, Parintins, São Gabriel da Cachoeira, Tabatinga e Tefé.

Cada unidade conta com corpo docente e técnico-administrativo próprio, composto por servidores efetivos, e é administrada por um diretor, eleito pela comunidade acadêmica, responsável pela gestão acadêmica e administrativa da unidade.